这个恐怕也是因人而异的。如果你有比较充足的财源保证，一开始遇到的困难大概会有这么一些。

一是租房。日本的大学一般不提供宿舍，除非你是交流交换学生，学校会提供相对廉价的宿舍，那就只要每月支付适当的房租和水电费就可以了。如果没有，你就要委托当地比较熟悉情况的中国或日本的朋友到当地的房屋中介去办理租房事宜，一般需要额外支付保证金押金等，稍稍有些小麻烦。另外，日本出租的房屋一般不带家具，你还得去配备基本的家具，建议去二手店，陆续购买一些最基本的家具和电器。这要花费一些钱。确定住所非常重要，以后你去办理各种手续，都需要有固定的住址。

二是办理银行卡，这本来是比较简单的，但银行方面会要求提供手机号码，因此你还必须要去办理一个手机。问题是，办理手机时，手机代理店要你提供银行卡号，这比较麻烦，日本人做事很认真也很死板，此时需要日语好的人来帮你沟通，应该可以解决。

三是你还需要去当地的政府、小城市的话市政府（市役所）、稍微大一些的城市的话是区政府（区役所）去办理一下外国人在留卡的后续手续（确定住址后提供一个居住证明，然而政府办事员会在后面盖上一个章，你就是这一地区的居民了），政府办事员一般都比较亲切，程序也比较简单。同时也需办理国民医疗保险，以防万一。

当然，你还需到学校里办理注册等各类手续，与相关老师见面，选课，然后进入正常的生活了。余下的就很简单。可以去买一辆二手自行车，近距离活动就靠它了，日本交通费比较贵，学生骑自行车不少。我在日本的小城市时，基本上都是骑自行车。日本的货币电子化程度不如中国，口袋里需要带一些现金。如果你的日语还不够好，那么到了当地后，努力学习语言是第一要务，建议在国内时就掌握基本功，到那里后会轻松不少，且日语的提高也很快。如果口袋里的钱不算太充裕，建议可去打工，语言越好工作越好找。适当的打工也是人生的一种历练。

其他，就是与人沟通了，这要看个人的能力了。我认为，沟通力是人的诸多能力中的重要的一种。当然，还要遵纪守法。