1、简单点讲，在留资格是法务省下属的入管局出具的证明，说明日本政府已经原则上同意你去日本长期居住了。

2、但你是不是能顺利入境，就必须通过外务省下属的日本领馆的核实，发给你签证，说明同意你可以入境日本了。

3、入管局同意你去日本居住，但不代表领馆会同意你入境。因为万一你交给入管局的材料有假、或者情况有所隐瞒、或者你去日本的目的与你申请签证的目的不一样等等情况。入管局只是看书面材料的，有可能无法猜到最真实的情况。

4、但领馆是日本政府驻世界各地的情报机构，他会去核实一些情况，如果发现有不一致、或者让人怀疑的地方，自然不会给你签证。