你这个问题太大了。
目前中国医学界承认的医疗水平和科研实力都比较好的是
北京协和医学院
北京大学医学部
中山大学医学院
复旦大学医学院
上海交通大学医学院
华中科技大学同济医学院
四川大学华西医学中心
以上排名不分先后，但是top2 肯定是协和医学院和北医。

就世界上而言，美国医学科研是比较好的，优秀的医学院有约翰霍普金斯大学、哈佛大学医学院、耶鲁大学医学院，这三个是最优秀的。其余的大学平分秋色吧，比如加州大学系统的。其余一些州立大学的医学院也是不错的。英国的是牛津大学和剑桥大学，另外伦敦大学系统的也不错。德国、法国、瑞典的大学里的医学院也是不错的。

亚洲方面香港大学医学院、日本的东京大学、韩国的首尔大学都是比较优秀的。

这些医学院已经够了吧？呵呵。其实你可以查一下国际上各大学的排名和医学专业的排名，个别留学资讯网站上就有。比如太傻和新航道等等。每年都会有变化，但是总体上还是比较固定的。

世界上医学院的骨科顶尖的应该是最好的是Mayo Clinic, Rochester, Minn等等. US News每年都会有美国的Orthopedics的排名，应该也是美国的世界上比较优秀的了。
这个是最新的前十名
#1
Hospital for Special Surgery
New York, NY

#2
Mayo Clinic
Rochester, MN

#3
Massachusetts General Hospital
Boston, MA

#4
Cleveland Clinic
Cleveland, OH

#5
Johns Hopkins Hospital
Baltimore, MD

#6
Duke University Medical Center
Durham, NC

#7
Barnes-Jewish Hospital/Washington University
Saint Louis, MO

#8
UPMC-University of Pittsburgh Medical Center
Pittsburgh, PA

#9
University of Iowa Hospitals and Clinics
Iowa City, IA

#10
Rush University Medical Center
Chicago, IL

这是美国US NEWS对美国神经科各大医院的前十名：
#1
Johns Hopkins Hospital
Baltimore, MD
#2
Mayo Clinic
Rochester, MN
#3
Massachusetts General Hospital
Boston, MA
#4
New York-Presbyterian University Hospital of Columbia and Cornell
New York, NY
#5
University of California, San Francisco Medical Center
San Francisco, CA
#6
Cleveland Clinic
Cleveland, OH
#7
Ronald Reagan UCLA Medical Center
Los Angeles, CA
#8
St. Joseph's Hospital and Medical Center
Phoenix, AZ
#9
NYU Langone Medical Center
New York, NY
#10
Barnes-Jewish Hospital/Washington University
Saint Louis, MO

软组织你是指的什么专业呢？请具体一点。

这个是美国US NEWS 对遗传专业的排名 前十名
（这个不是从US NEWS上查的，是从一个留学网站上查的，仅供参考）
2010年USNEWS 美国研究生专业排名——科学院（遗传学/基因组学/生物信息专业 Genetics / Genomics / Bioinformatics）

1、 斯坦福大学 Stanford University

2、 麻省理工学院 Massachusetts Institute of Technology

3、 哈佛大学 Harvard University

4、 加州大学 – 伯克利 University of California–Berkeley

5、 华盛顿大学 University of Washington

5、 圣路易斯华盛顿大学 Washington University in St. Louis

7、 约翰斯霍普金斯大学 Johns Hopkins University

8、 加州大学 – 旧金山 University of California–San Francisco

8、 耶鲁大学 Yale University

10、普林斯顿大学 Princeton University

正好我是学医的，这几天有空，花了我接近两个小时给您搞这个东西，弄得好不好另说，怎么地您得给点分吧？呵呵