赴日留学生可以入学的高等教育机构有5种，即大学（本科）、大学院（即研究生院）、短期大学、专修学校专业课程和高等专门学校。

1、大学本科：修业年限为4年。但医学、牙科学和兽医学为6年。

2、大学院（即研究生院）：硕士课程（修业年限为2年）；博士课程（修业年限为5年），大多分为前期课程（2年：相当于上述硕士课程）和后期课程（3年）。但医学、牙科学和兽医学的博士课程（在学完医学、牙科学和兽医学系的6年课程后可以升学）的修业年限为4年。也有的大学开设5年一贯制的博士课程或只设后期 3年的博士课程。

3、短期大学：修业年限为2年或3年。家政、人文、教育及社会方面的专业占大多数。

4、专修学校（即专科学校）：专修学校中设有专业课程的又被称为“专门学校”，属高等教育机构。专门学校进行职业教育，并教授实际生活所需的技术、知识和技能。修业年限为1年以上，通常以2年课程为主。

5、高等专门学校（即中专）：高等专门学校以初中毕业生为对象，进行5年（与商船有关的学科为5年6个月）一贯制教育，其目的在于培养必要的职业能力。高等专门学校除工业方面的学科外，还设置与商船有关的学科及其它领域的学科。

此外，有些大学和大学院（即研究生院）除正式学生外，还设置有单科生（选修特定的科目，可取得学分）、旁听生（可旁听特定的科目，但不能取得学分）和研修生（在一定期间内，从事特定的专业项目的研究）等制度。

虽然留学目的因人而异，但韩日联合交流会的自身日本留学顾问老师建议赴日留学生，应从以下三个方面，即（1）是不是以获得学位或长期研究为目的而留学？（2）是不是以在日语教育设施或私立大学的留学生别科（即非本科课程）掌握日语为目的而留学？（3）是不是以掌握特定的专业技术为目的而留学？这三个方面认真考虑之后，寻找最符合自身目的的教育机构。